Lina Inverse, la célèbre sorcière, se voit proposer une mission a priori banale pour elle : retrouver le Croc du Roi du Mal, un joyau rare se trouvant sur l'île du bout du monde, un lieu encore inexploré par ceux qui vivent de l'autre côté de la fameuse barrière qui emprisonne les dieux. Secondée par le fidèle Gourry Gabriev, le guerrier à l'intellect limité, Lina part à bord d'un frêle esquif s'aventurer dans la Mer du Mal. Le danger ne se fait pas attendre car, très vite, le duo est séparé à cause de ce qui ressemble fortement à un dragon aquatique. Après avoir recouvert ses esprits, Lina fait la connaissance de Lyos, un étrange garçon armé d'une épée à la puissance dévastatrice...